您好!我原是A公司出纳,公司一直没有业务,日常所需经费都是由老板娘异地汇入我个人帐户的(老板异地还有一家公司和A公司的分公司),再提款交进公司帐户,帐都是做往来款项.我不做后,A公司扣押我的养老保险和工资,以此要求我进行对帐,结果发现05年有笔3万元我没记录去向,当时忘了.对我产生怀疑.请问如走法律程序,他们能告我职务侵占吗?这笔款是从老板娘的个人存折汇入我的个人存折的,
对方是否可以证明这是公款呢?

公司应该有公司的帐户，老板娘是从她个人的帐户汇入你的帐户的，估计职务侵占罪很难构成，不过，如果你没法证明这笔钱的去向，她可以打民事官司，以不当得利要求你返回。
员工辞职应该提前30天书面通知，公司和劳动者都有义务配合做好工资结算、工作交接、档案移转等工作，但应该及时进行，公司扣押你的养险和工资是违法的，你可以走法律途径解决。